Актуальность. Заболеваемость рекуррентными респираторными инфекциями (РРИ) у детей стремительно увеличивается с каждым годом и составляет более 50% общего числа болезней. Патогенез РРИ основан на несостоятельности звеньев иммунной системы, преимущественно вызванной нарушениями иммунного гомеостаза слизистых оболочек, коррекция которых возможна благодаря адекватной колонизационной резистентности барьерных систем растущего организма. В связи с этим представляется актуальным анализ микробиотического фактора кишечного и респираторного биотопов, поиск возможных патогенетических связей состава микробиоты с частыми случаями возникновения острых респираторных инфекций у детей. Цель: определить особенности микробиоты у детей с РРИ и установить изменения микробиоты верхних дыхательных путей и кишечника при острых респираторных инфекциях. Материалы и методы. Комплексно обследовано 90 детей в возрасте от 1 года до 6 лет включительно: мальчиков было 46 (51%), девочек - 44 (49%). Основную группу составили 60 детей, преимущественно это были пациенты из группы часто болеющих детей, референтную группу составили 30 условно здоровых детей. В период клинического благополучия у всех наблюдавшихся детей проводили заборы мазков с задней стенки глотки, а также получали образцы кала для качественного и количественного анализа состава микробиоты орофарингеальной зоны и кишечника соответственно методом генетического секвенирования региона V3-V4 гена 16S рибосомальной РНК и последующего биоинформатического анализа данных. Результаты. Установлено значимое уменьшение микробного разнообразия состава микробиоты орофарингеальной зоны и кишечника у детей основной группы при сравнении с условно здоровыми детьми. В обеих группах детей доминирующими энтеротипами являются Firmicutes и Bacteroidota (до 96% состава всей микробиоты). В микробиоте орофарингеальной зоны детей основной группы преобладали Haemophilus influenzae/parainfluenzae (до 60%), Neisseria meningitidis/subflava (до 30%), Streptococcus anginosus/australis/pneumoniae/pseudopneumoniae (до 25%). При этом в микробиоте кишечника детей основной группы существенно уменьшено количество Bifidobacterium (менее 1,5%), отсутствуют или крайне снижены Lactobacillus (менее 0,2%). В кишечной микробиоте детей с РРИ отсутствуют или крайне уменьшено число бактерий продуцентов масляной кислоты (бутирата): бактерии рода Roseburia - менее 0,5-3,0%, Faecalibacterium - менее 5,5%, Anaerostipes - менее 0,1-1,5%. Установлено также, что в кишечной микробиоте детей данной группы отсутствуют или крайне снижено число рода Ruminococcus (менее 0,1%), ответственных за синтез короткоцепочечных жирных кислот (пропионат и ацетат), обладающих противовоспалительным действием. Заключение. У детей основной группы установлен микробный дисбаланс между бактериями, продуцирующими про- и противовоспалительные факторы, а также выявлено крайне низкое содержание или отсутствие бактерий продуцентов масляной кислоты - ключевого противовоспалительного метаболита, участвующего в поддержании иммунного гомеостаза, предотвращающего повышенную кишечную проницаемость, снижающего системное воспаление, что уменьшает резистентность слизистых оболочек к действию микробных агентов.