Актуальность. Микробиота является важным фактором здоровья человека. Её индивидуальный состав зависит от генетических факторов и влияний внешней среды, однако вклад каждого фактора в формирование и функционирование нормальной микробиоты не очевиден. Конкурентная борьба микроорганизмов за железо может быть важным механизмом контроля состава микробиоты. Цель работы: определить особенности состава микробиоты кишечника у подростков на фоне железодефицитных состояний (ЖДС). Материалы и методы. Комплексно обследовано 122 воспитанника кадетского корпуса 1-2-й группы здоровья, средний возраст 14,8 ± 0,9 года. В соответствии с критериями ВОЗ, железодефицитная анемия (ЖДА) была обнаружена у 3 подростков, латентный дефицит железа (ЛДЖ) - у 20. Проведён анализ микробиоты путём посева исследуемого материала на расширенный перечень искусственных питательных сред с последующим культивированием в аэробной и анаэробной газовой атмосфере и идентификацией с помощью MALDI-ToF масс-спектрометрии. Результаты. У пациентов с ЖДС отмечалась достоверно чаще встречались штаммы Bacteroides fordii, Lactobacillus amylovorus, Lactobacillus brevis, Lactobacillus gasseri, Lactobacillus salivarius, Streptococcus anginosus. Несмотря на то, что на современном этапе знаний и представлений о метаболизме указанных бактерий не представляется возможным говорить об их потенциальной роли в развитии ЖДС, имеющиеся исследования позволяют предположить неслучайное изменение числа штаммов. Увеличение числа отдельных видов Lactobacillus может отражать известную независимость данного вида от концентрации железа в окружающей среде. С другой стороны, Lactobacillus может оказывать непосредственное влияние на всасывание железа, т.е. отражать адаптивные изменения в условиях ЖДС. Выявлена тенденция к снижению частоты выделения штаммов Enterococcus faecalis (p = 0,055) у пациентов с ЖДС. У подростков с ЖДА в составе микробиоты отсутствовали представители типов Bacteroidetes и Actinobacteria. При комплексной оценке микробиоты кишечника у детей с ЖДА во всех случаях выявлены неблагоприятные изменения, тогда как у детей с ЛДЖ в 25% (n = 5), а у здоровых в 41,4% (n = 41) случаев было нормальное состояние микробиоты кишечника. Заключение. ЖДС, даже в виде ЛДЖ, приводят к неблагоприятным изменениям микробиоты кишечника у подростков, способствуя обеднению её состава.