Варианты нуклеотидной последовательности гена CFTR у больных муковисцидозом в Москве

Актуальность. Муковисцидоз (МВ) — аутосомно-рецессивное заболевание, обусловленное мутацией гена CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator), кодирующего трансмембранный белок, который формирует хлорный канал в мембранах эпителиальных клеток, что приводит к нарушению функции всех экзокринных желёз, характеризуется выраженной гетерогенностью. Описано более 2000 мутаций гена CFTR. Частота их встречаемости составляет 1 : 10 000 живых новорождённых. Цель: определить варианты нуклеотидной последовательности гена CFTR у больных МВ в Москве в сравнении с другими субъектами РФ.

Материалы и методы. Обследовано 340 больных МВ. Проведён анализ общего числа патогенных вариантов в гене CFTR у детей, наблюдающихся в медико-генетическом отделении Московского центра неонатального скрининга в 2024 г.

Результаты. Обнаружено 770 мутаций (100%) в гене CFTR у детей, больных МВ. Частота аллелей представлена в порядке убывания: F508del — 384 (49,8%), CFTRdele2,3(21kb) — 49 (6,36%), 1677delTA — 26 (3,38%), W1282X — 23 (2,98%), 2143delT — 17 (2,2%), c.3849+10kbC>T — 16 (2%), E92K — 16 (2%), N1303K — 15 (1,94%), G542X — 15 (1,94%), 21.84insA — 12 (1,56%), L138ins — 12 (1,56%), F508del+комплексный аллель — 12 (1,56%), W1282R — 11 (1,43%), R1162X — 7 (0,9%), S1196x — 5 (0,65%), D110H — 5 (0,65%), 394delTT — 4 (0,52%), 4428insGA — 4 (0,52%), S446X — 4 (0,65%); R1070Q — 4 (0,52%), 3821delT — 3 (0,39%), 2789+5G>A — 3 (0,39%), 1898+1G>C — 3 (0,39%), R334W — 3 (0,39%), Asn415 — 2 (0,26%), Y362X — 2 (0,26%), 604insA — 2 (0,26%), R553X — 2 (0,26%), 3944delTG — 2 (0,26%), R1158X — 2 (0,26%), S1455 — 2 (0,26%), W1310X — 2 (0,26%), 3272-26A>G — 2 (0,26%), c.29.98.del — 2 (0,26%), Ser 1058X — 2 (0,26%), 621+1G>T — 2 (0,26%), T1036N — 2 (0,26%), c.71201G>T — 2 (0,26%), G85E — 2 (0,26%), 712-1G>T — 2 (0,26%), c.2756A>G — 1 (0,13%), S1159F — 1 (0,13%), 3272-16T>A — 1 (0,13%), c.115C>T — 1 (0,13%), CFRE dele12,13 — 1 (0,13%), R75Q — 1 (0,13%), L138ins — 1 (0,13%), 1366delG — 1 (0,13%), CFTRdup1-11 — 1 (0,13%), 1367del — 1 (0,13%), CFTRdup6b-10 — 1 (0,13%), c.2012delT — 1 (0,13%), 3344delTG — 1 (0,13%), c.508del — 1 (0,13%), D979V — 1 (0,13%), R785X — 1 (0,13%), E528X (1716/GA) — 1 (0,13%), 2148insA — 1 (0,13%), 3659delC — 1 (0,13%), 3815-3816insTTG — 1 (0,13%), S945L — 1 (0,13%), 1766+2tC — 1 (0,13%), W1281X — 1 (0,13%), 3849G>A — 1 (0,13%), c.1608delA — 1 (0,13%), c.237G>A — 1 (0,13%), GLN 1476Term — 1 (0,13%), c.1219 — 1 (0,13%), IVC13+2TC — 1 (0,13%), CFTRdup6b,7 — 1 (0,13%), K710X — 1 (0,13%), R75X — 1 (0,13%), L1335P — 1 (0,13%), R792X — 1 (0,13%), 1898+1G>C, S1159P — 1 (0,13%), Leu24Ter — 1 (0,13%), N1303K — 1 (0,13%), S466X;  R1070P — 1 (0.13%), L138ins+c.1022C>A — 1 (0,13%), S912L — 1 (0,13%), N313H — 1 (0,13%), N145* — 1 (0,13%), Thr582Lys — 1 (0,13%), c.108G>A — 1 (0,13%), P5L — 1 (0,13%), c.1243_1247del — 1 (0,13%), Q98R — 1 (0,13%), W277X — 1 (0,13%), 4015delA — 1 (0,13%), Y569D — 1 (0,13%), 4095+1G>T — 1 (0,13%), K785X — 1 (0,13%), R117H — 1 (0,13%), c.3196C > T — 1 (0,13%), c.3281C>G — 1 (0,13%), R347P — 1 (0,13%), c.532G>A — 1 (0,13%), R352Q — 1 (0,13%), 3199del6; I148T — 1 (0,13%), 583delC — 1 (0,13%). В процессе анализа было установлено, что вариант F508del у детей с МВ в Москве встречается в 8 раз чаще, чем CFTRdele2,3(21kb), что совпадает с данными регистра больных МВ в России. На 3-м месте по частоте находится мутация 1677delTA, что отличает московскую когорту от общего регистра. Патогенный вариант W1282X у московских детей с МВ встречается чаще в 1,7 раза по сравнению с другими субъектами по данным регистра. Вместе с тем у больных МВ в Москве были обнаружены мутации, ранее не описанные в регистре пациентов с МВ: 1898+1G>C, E528X (1716G/A), c.2756A>G. У 4 больных МВ мутации не обнаружены. Однако клинические проявления соответствовали диагностическим критериям диагноза МВ (положительный неонатальный скрининг, дважды положительная потовая проба, низкие значения фекальной эластазы).

Заключение. Больные МВ, проживающие в Москве, отличаются широким разнообразием нуклеотидных вариантов гена CFTR. Эти данные показывают значимость регионального мониторинга и молекулярно-генетической диагностики МВ для своевременного выявления заболевания и улучшения стратегии лечения, особенно с акцентом на патогенетическую терапию.